Identification of genogroups of Infectious Bursal Disease Virus in poultry farms at Colombia / Identificación de genogrupos del virus de la enfermedad de gumboro en granjas avícolas en colombia

RESUMEN El virus de la enfermedad de Gumboro (IBDV) es un avibirnavirus con genoma dsARN que presenta altas tasas de mutación y recombinación. A pesar del efecto inmunosupresor en aves y la frecuencia con que ocurre la infección por este agente en el país son pocos los estudios que caracterizan los cuadros clínicos y se desconoce cuáles son los genogrupos circulantes. Esta investigación tuvo como objetivo determinar la frecuencia de lesiones histopatológicas en órganos del sistema inmune e identificar los genogrupos del IBDV en aves comerciales de Colombia. Para determinar la frecuencia de presentación de lesiones en órganos del sistema inmune se analizaron 381 casos clínicos de las bases de datos del Laboratorio de Patología Aviar (LPA) de la Universidad Nacional de Colombia, sede Bogotá (periodo 2016-2018). Asimismo, se secuenciaron los productos de RT-PCR del gen que codifica para la proteína viral VP2 provenientes de 35 muestras de bursas de Fabricio. Como resultado se encontró evidencia de lesiones microscópicas compatibles con procesos de inmunodepresión en órganos del sistema inmune (bursa de Fabricio, timo, bazo y médula ósea) en el 25 % (97) de los casos analizados y se identificaron los genogrupos 1, 2 y 4 en la siguiente proporción: genogrupo 1-69 % (virus clásicos), genogrupo 2-25 % (variantes) y genogrupo 4-6 % (identificado en Suramérica). Estos hallazgos demuestran la presencia de lesiones en órganos del sistema inmune y la existencia de los genogrupos 1, 2 y 3 del IBDV circulando en aves comerciales en Colombia. Esta es la primera investigación en el país con este sistema de clasificación que permite evidenciar con mayor precisión los cambios en el genoma del IBDV. Lo anterior señala la necesidad de continuar con este tipo de estudios para tener una mejor comprensión de la infección en campo y orientar el diseño e implementación de estrategias de control.

ABSTRACT Infectious Bursal Disease Virus (IBDV) is an avibirnavirus with a dsRNA genome, which has a high mutation and recombination rates. Despite the immunosuppressive effect in poultry and the frequency of infections by this agent, few studies in Colombia that characterize the clinical signs and identify the circulating genogroups have been reported. This study aimed to determine the frequency of histopathological lesions in immune organs and to identify IBDV genogroups in poultry from Colombia. In this way, the Laboratorio de Patología Aviar (LPA) databases from the Universidad Nacional de Colombia (period 2016-2018) were analyzed in order to identify the frequency of lesions present in immune organs. 35 samples of the bursa of Fabricius, positive by RT-PCR, were sequenced to the gene that codes for the VP2 protein. 97 (25 %) cases showed microscopic lesions in the immune organs. The genogroups identified and the frequencies were: genogroup 1-69 % (classical viruses), genogroup 2-25 % (antigenic variants), and genogroup 4-6 % (identified in South America). These findings demonstrate the lesions of immune organs and the presence of different genogroups circulating in commercial birds in Colombia. This indicates the need to continue with these studies in order to have a better understanding of the infection in the field and to guide the design and implementation of control strategies.

Dynamics of porcine circovirus type 2 infection and neutralizing antibodies in subclinically infected gilts, and the effect on their litters / Dinámica de la infección por el circovirus porcino tipo 2 y títulos de anticuerpos neutralizantes en las cerdas de reemplazo subclinicamente infectadas, y el efecto en sus camadas / Dinâmica da infeção pelo circovirus porcino tipo 2 e títulos de anticorpos neutralizantes em porcas nulíparas subclínicamente infectadas e efeito em sua leitegada

Background: porcine circovirus type 2 (PCV2) is associated with reproductive disease in newly populated herds and in replacement breeding stock from new sources and is almost exclusively reported in gilts. Objective: the main purpose of this study was to assess the dynamics of porcine circovirus type 2 infection and neutralizing antibodies in subclinically infected gilts and the effect on their piglets. Methods: the study was conducted with 40 gilts selected at random from four breeding herds. Blood samples, nasal and vaginal swabs were obtained from the gilts at arrival, acclimatization, farrowing, and one day after farrowing. Colostrum samples were collected immediately after parturition and one day after farrowing. Blood, nasal swab, or tissue samples were collected from four piglets prior to suckling. All serums were analyzed by virus neutralization test (VNT) to establish the presence of antibodies. All samples were subjected to SYBER Green real-time PCR assay to detect PCV2 DNA. Results: high levels of viremia and viral load of PCV2 in nasal and vaginal swabs were found in healthy gilts at arriving, confirming the introduction of infected animals into the farms. In addition, most gilts were positive for PCV2 DNA in serum, nasal and vaginal swabs at farrowing. PCV2 shedding was also observed in nasal and vaginal fluids and colostrum even in presence of serum neutralizing antibodies (NA). Subclinically infected dams had detectable viremia, developed anti-PCV2 antibodies, and there was PCV2 DNA in tissue samples of their born alive and healthy piglets. PCV2a and PCV2b genotypes were confirmed in PCV2 subclinical infection in both dams and piglets in utero. Conclusion: replacement gilts can be infected with PCV2 before entering the farm and continuous exposure seems to occur horizontally in acclimatization and gestation units or before farrowing. Exposure and infection during gestation may result in infected but apparently healthy piglets.

Antecedentes: el circovirus porcino tipo 2 (PCV2) es asociado con casos de falla reproductivas en granjas recién pobladas, en granjas de cría para cerdas jóvenes y casi exclusivamente en cerdas de reemplazo. Los signos clínicos descritos son: incremento en los abortos durante la segunda y tercera etapa de la gestación, fetos momificados, mortinatos y el nacimiento de lechones débiles no viables. Objetivo: el principal propósito de este estudio fue evaluar la dinámica de la infección por el circovirus porcino tipo 2 y títulos de anticuerpos neutralizantes en las cerdas de reemplazo subclinicamente infectadas y el efecto en su camada. Métodos: este estudio se realizó con 40 cerdas de reemplazo seleccionadas al azar en cuatro granjas porcinas de cría. De cada animal se colectaron muestras de sangre, hisopados nasales y vaginales al ingresar a la explotación, durante la cuarentena, en el momento del parto y un día post-parto. Igualmente, se colectaron muestras de calostro al terminar el parto y un día post-parto. De cuatro lechones neonatos, se colectaron muestras de sangre, hisopado nasal y tejidos antes de consumir calostro. Todos los sueros fueron analizados mediante la técnica de sero-neutralización para detectar anticuerpos anti-PCV2 y todas las muestras se analizaron por una técnica SYBER Green en tiempo real para detectar el ADN viral. Resultados: la detección de un alto nivel de viremia y la demostración de la eliminación viral en hisopados nasales y vaginales permitió demostrar la introducción a las granjas de cerdas de reemplazo infectadas, aparentemente sanas. Igualmente, el suero y los hisopados nasales y vaginales fueron positivos por PCR SYBER Green en la mayoría de las hembras al parto. Se demostró eliminación viral en fluidos nasales, vaginales y en calostro en presencia de anticuerpos séricos neutralizantes. La infección de las cerdas se manifestó en viremia, en el desarrollo de anticuerpos frente al PCV2 y en la presencia del ADN viral en los tejidos de lechones neonatos aparentemente sanos. Los genotipos PCV2a y PCV2b fueron detectados en la infección in utero. Conclusiones: las cerdas de reemplazo pueden estar infectadas con el PCV2 antes de ingresar a las explotaciones de cría o pueden infectarse por transmisión horizontal durante la cuarentena y gestación. La exposición e infección viral de las cerdas durante la gestación puede resultar en infección subclínica de los lechones neonatos.

Antecedentes: o circovírus suíno tipo 2 (PCV2) está associado a casos de falha reprodutiva em granjas recém-assentadas e fazendas de criação de marrãs e afeta principalmente a porcas nulíparas. Clinicamente observam-se aumento dos fetos abortados no segundo e terceiro estágios da gravidez, fetos mumificados, natimortos e nascimento de leitões inviáveis. Objetivo: o principal objetivo deste estudo foi avaliar a dinâmica da infeção pelo circovirus porcino tipo 2 e os títulos de anticorpos neutralizantes em porcas nulíparas com infecção subclínica e o efeito em sua leitegada. Métodos: este estudo foi realizado com 40 porcas em quatro granjas selecionadas aleatoriamente. Foram coletados de cada animal amostras de sangue, esfregaços nasais e vaginais ao entrar na fazenda, durante a quarentena, no parto e um dia pós-parto. Também foram coletadas amostras de colostro no parto e um dia pós-parto. Amostras de sangue, esfregaços nasal e tecido foram tomadas de quatro leitões antes de consumir colostro. As amostras foram analisadas pelo PCR Sybr Green para detectar e quantificar o PCV2. A detecção de anticorpos contra o vírus do PCV2 em soro foi realizada pelo teste de soroneutralização e todas as amostras foram analisadas através da técnica de SYBR Green PCR para a detecção do ADN viral. Resultados: a detecção de um nível elevado de viremia e a demonstração da excreção viral em esfregaços nasais e vaginais nas fêmeas permitiram demonstrar a introdução de porcas nulíparas aparentemente saudávels. Igualmente, o soro e as secreções vaginais e nasais foram positivos por PCR SYBR Green em tempo real na maioria das porcas no parto. Observou-se excreção viral em secreções vaginais e nasais e colostro na presença de anticorpos neutralizantes. A infecção das porcas manifestou-se no desenvolvimento de anticorpos neutralizantes e detecção de infecção fetal em leitões recém-nascidos aparentemente saudáveis , confirmando a transmissão vertical do PCV2. Os genótipos PCV2a e PCV2b foram detectados na infecção in utero. Conclusões: as porcas nulíparas podem estar infectadas com PCV2 antes de entrar nas granjas de criação e pode ser infectadas por transmissão horizontal durante a quarentena e gravidez. Exposição e infecção viral durante a gestação pode resultar em infecção subclínica de leitões recém-nascidos.

Comportamiento del virus de la bronquitis infecciosa aviar en aves con sintomatología respiratoria provenientes de granjas de producción del Departamento de Cundinamarca / Avian Infectious Bronchitis virus behavior in birds from commercial farms with a history of respiratory disease, located in the department of Cundinamarca

Objetivo. Evaluar la dinámica serológica contra el virus de bronquitis infecciosa aviar y su relación con la presentación y/o antecedentes de signos clínicos y hallazgos patológicos, bajo condiciones de campo. Materiales y métodos. Se realizó un muestreo al azar en dos fases, en pollo de engorde y reproductoras de granjas del Departamento de Cundinamarca. En la primera fase se tomó muestra de sangre a un total de 224 aves, distribuidas en 7 granjas. En la segunda fase, realizada 20 días posteriores al primer muestreo, se tomó una segunda muestra al mismo número de aves empleadas inicialmente. Las muestras de los sueros obtenidos se emplearon para la realización del inmunoensayo ligado a enzima (ELISA), diseñado para detectar anticuerpos frente al virus de la bronquitis infecciosa aviar en suero sanguíneo. Resultados. Se obtuvo que del total de las granjas analizadas el 85.72% mostró reactividad serológica al virus de la Bronquitis Infecciosa aviar (VBIA), con correlación ante la presencia de los signos clínicos o antecedentes respiratorios en granja.

Objective. Evaluate the serological dynamics against avian infectious bronchitis virus and its relationship with the presentation and / or a history of clinical signs and pathological findings, under field conditions. Materials and methods. A random sampling was conducted in two phases, in broiler and breeder farms located in the Department of Cundinamarca. In the first phase blood sample were taken from a total of 224 birds, distributed over the 7 farms. In the second phase, carried out 20 days after the first, a second sample was collected from the same number of birds used in the first phase. The serum samples were used to carry out the enzyme linked immunoassay (ELISA) intended to detect antibodies against avian infectious bronchitis virus in blood serum. Results. As a result it was found that from the total farms analyzed the 85.72% showed serologic reactivity against Avian Infectious Bronchitis Virus (AIBV) that correlated to the presence of clinical signs or previous history of respiratory disease in the farm.

Diferenciación de cepas de Mycoplasma gallisepticum a partir de RFLP / Differentiation of Mycoplasma gallisepticum Strains through RFLP

La micoplasmosis aviar es una enfermedad que afecta considerablemente al sector avícola, lo que se ve reflejado en la disminución de parámetros productivos en aves de engorde ponedoras de huevo fértil y ponedoras de huevo comercial. Los costos de su presentación son tan altos que es imposible la supervivencia de la avicultura industrial sin pensar en el control efectivo o en su erradicación. Existe un gran interés en la tipificación de cepas de M. gallisepticum(Mg) tanto vacunales como de campo, aspecto clave para el manejo de la enfermedad, pero aún no existe un método definitivo de caracterización de cepas de Mg. En la actualidad se están estudiando genes relacionados con proteínas de superficie —gapA y mgc2, lipoproteína (lp)— que permitan identificar y caracterizar genómicamente al Mg. En el presente estudio se amplificaron regiones del gen lp a partir de las cepas F y Ts-11 del Mg por la técnica de reacción en cadena de la polimeras a (PCR) que dio un amplicón de 455 pb para cada una de las cepas; a cada uno de las aplicaciones se les hizo la prueba de polimorfismo de longitud de los fragmentos de restricción (RFLP) con la enzima Taq I, lo que permitió diferenciar cepas vacunales de cepas de campo obtenidas a partir de muestras de hisopos traqueales tomados en granjas de explotación comercial. Se demostró que el PCR-RFLP es un método adecuado de diagnóstico de la micoplasmosis en nuestro medio...

Avian mycoplasmosis is a disease that considerably affects the poultry sector, which is reflectedin the decrease of the production parameters in fertile and commercial egg layingbroilers. Presentation costs are so high that it is impossible for the poultry industry to survivewithout thinking of its effective control or eradication. There is great interest in the type ofM. gallisepticum (Mg) strains, both vaccine and field, which are key aspects to handle thedisease, but there is still no definitive method for Mg strain characterization. Genes relatedto surface proteins —gapA and mgc2,lipoprotein (lp)— that make it possible to identify andcharacterize the Mg genomically are currently being studied. In this study, regions of the lpgene were amplified from strains F and Ts-11 of Mg through the polymerase chain reaction(PCR) technique, which gave an amplicon of 455 bp for each of the strains; each of amplicons was applied the restriction fragment length polymorphism (RFLP) test with theTaq I enzyme, which made it possible to differentiate vaccine strains from field strains obtainedfrom tracheal swab samples taken at commercial farms. It was demonstrated that PCRRFLPis an appropriate method of diagnosis of mycoplasmosis in our environment...

A micoplasmose aviar é uma doença que afeta consideravelmente o setor avícola, isso se refletena diminuição de parâmetros produtivos em aves de engorde poedeiras de ovo fértil epoedeiras de ovo comercial. Os custos de sua apresentação são tão altos que é impossível asobrevivência da avicultura industrial sem pensar no controle efetivo ou em sua erradicação.Existe um grande interesse na tipificação de cepas de M. gallisepticum (Mg) tanto vacinaiscomo de campo, aspecto chave para o manejo da doença, mas ainda não existe um métododefinitivo de caracterização de cepas de Mg. Na atualidade estão sendo estudados genes relacionadoscom proteínas de superfície —gapA e mgc2, lipoproteína (lp)— que permitamidentificar e caracterizar genômicamente ao Mg. No presente estudo se amplificaram regiõesdo gen lp a partir das cepas F e Ts-11 do Mg pela técnica de reação em cadeia da polimerase(PCR) que deu um amplicon de 455 pb para cada uma das cepas; a cada um dos ampliconsfoi feito o teste de polimorfismo de longitude dos fragmentos de restrição (RFLP) com aenzima Taq I, o que permitiu diferenciar cepas vacunais de cepas de campo obtidas a partirde mostras de mostras traqueais tomadas em granjas de exploração comercial. Demonstrou-seque o PCR-RFLP é um método adequado de diagnóstico da micoplasmose em nosso meio...